Endoskopski pregled se vrši pomoću sitne kamere koja se nalazi na vrhu duge fleksibilne cijevi kojom se ulazi u unutrašnjost šupljih organa. Ovom metodom se najčešće obavljaju pregledi prednjih respiratornih puteva, pregled jednjaka i želuca kao i pregled rektuma i kolona.

Endoskopija je posebno značajna za dijagnostifikovanje prisustva stranih tijela.

Endoskopija kao dijagnostička procedura se izvodi u opštoj anesteziji, a prije samog izvođenja procedure neophodno je da se urade krvne analize. Pored nalaza neophodna je i priprema pacijenta za endoskopiju, a ona se ogleda u tome da pacijentu mora biti uskraćena hrana 12 do 24 časa i voda 8 časova pre izvođenja intervencije.

Endoskopija kao procedura prosečno traje oko 30 minuta i životinja leži na levoj strani.